管道和净化器在清洗过程中产生的废液，来源并不单一。高压热水冲洗管壁会带下大量油泥，浸泡挡油板、滤网的清洗槽会残留含油污水，净化器电场冲洗和集油槽清空也会产生油水混合液，这些统称清洗废液。废液中的油脂、悬浮物和清洗剂成分差异较大，若直接倒进厨房地漏，容易在下水管内重新凝结，造成堵塞和异味返溢。因此安排厨房排烟清洗时，废液的收集与去向要在作业前就确定下来，包括收集容器、暂存位置和转运方式。
现场收集一般按部位分开进行。管道冲洗的废水用带滤网的收集桶承接，先拦截大块油渣再排入废液箱；清洗槽内的浸泡液静置后撇去浮油，下层水再集中处理。作业面周围铺设防渗垫，桶口加盖防止泼溅，转运车辆要有防漏措施。废液量与实际清洗范围有关，清洗废油废水的处理要在作业前安排妥当，清洗范围较大时产生的废液更多，需要提前准备足够容积的收集容器，并与有资质的处理单位对接处置。
废液处置记录是验收时的常见核对内容，一般包括产生量、暂存时间、转运去向和接收凭证。这几项与清洗范围、管道长度和积油厚度直接相关，而后者又和系统本身的排烟条件有关。排放不畅、油烟外溢的小店，管道内油垢往往更厚，清洗产生的废液也更多，这种情形在参考小餐馆排烟方案与安装时，通常会把管道走向和净化器配置一并考虑，从源头减少后期清洗强度。废液处置与清洗质量一样，都应留下可追溯的记录。
